Zotero是一款开源、跨平台的知识管理软件。

本系列将介绍如何使用Zotero，搭建最佳的文献生态，服务于我们的科研工作。Zotero官方网站提供下载。

Zotero软件优点

在浏览器端利用Zotero Connector，可以实现对各大主流数据库（Web of Science、Pubmed、ScienceDirect等）或搜索引擎（Google Scholar、百度学术、Research Gate等）具有文献一键抓取能力，甚至支持豆瓣图书的抓取。抓取内容包括文献元数据、PDF、网页链接等。
跨平台实时同步功能，便于随时随地在多平台访问文献。
可与第三方云存储（如坚果云）绑定，达到无限扩展Zotero存储空间的目的，在我看来这是Zotero最具特色的功能了，后面会专门介绍。
作为一款开源软件，Zotero的更新速度很快，保证了它的使用体验。Zotero占用空间很小，运行起来非常流畅，这一点比Endnote有优势。
Zotero支持插件扩展，这使得Zotero更加强大，如PDF文件自动命名功能。
Zotero提供分组、标签等功能，方便了我们对文献的管理。灵活使用标签功能，可以大大提高文献管理的效率。
提供Windows和Mac端的Office插件，方便学术论文写作。Zotero支持非常丰富的期刊参考文献格式，写论文时不用再愁了。
Zotero还支持Rss订阅，这一功能使得Zotero能够把学术文献和各种其他资讯集中在一块，可以说融合了科研+生活。因此，Zotero构建的不仅是文献管理生态，更是一个知识生态。

Zotero入门

Zotero客户端配置

首先到Zotero官网注册一个Zotero账号。

启动Zotero客户端（本文以Mac版本示范，version 5.0.74），打开首选项设置Preferences，如下。

选择General，推荐按照如下设置。

选择同步（Sync），登录Zotero账户，如下。

这里需要注意的是，Zotero的存储包含数据信息和PDF附件，可以分别存储。其中，数据信息可以理解成包含元数据的文献列表。

由于Zotero的免费空间只有300M，而PDF文件占用的空间较大，因此这300M空间肯定是不够用的。

有钱任性的可以直接购买Zotero的空间，不过后面我会介绍如何使用坚果云作为WebDAV无限扩展Zotero的空间。

接下来介绍ZotFile插件的使用。ZotFile有很多功能，比如帮助自动命名PDF文件，即PDF文件会拥有一个统一的命名方式，这会为我们带来很大方便。

打开菜单栏Tools的安装插件选项Add-ons，如下。

然后到网上（http://zotfile.com）下载Zotfile，并在下面的窗口中添加进去。

安装好后，在Tools菜单栏会出现ZotFile的设置选项，如下。

打开ZotFile Preferences，选择Renaming Rules，勾上Use Zotero to Rename。下面是按照作者_时间_标题的格式对PDF文件命名的，大家也可以按照自己的喜欢更改格式。

设置好重命名后，那么如何使用呢？任意选择Zotero的一条包含PDF附件的条目，按下图操作即可完成PDF文件的命名。

如何导入文献？

Zotero有多种导入文献的方式，比如：

网页识别
抓取PDF元数据
手动输入
通过标示符增加：Add by identiﬁer (DOI, ISBN, PMID)
文件导入（比如从Endnote导入）

本篇文章重点介绍网页识别和PDF元数据抓取。

1. PDF元数据抓取

拖动一PDF文件到Zotero的某个分组中，右击该PDF文件，选择“retrieve metadata for PDF”，如下。

如果抓取成功（注意，Zotero只能抓取英文文献的PDF文件，中文文献可以通过其他方式导入），结果如下所示。

2. 网页抓取

要想做到网页抓取，需要首先安装Zotero Connector浏览器插件。下面以安装好插件的Chrome浏览器示范Zotero对不同数据库的网页抓取能力。

a. Google scholar

由于Zotero支持对谷歌学术搜索结果的识别，因此当我们在谷歌学术搜索文献后，插件形状会变成文件夹的图标，点击该图标，即可选择导入哪些文献到Zotero中，默认导入到当前被选中的分组中。

b. 中国知网

很多人可能需要保存中文文献的需要，幸运的是Zotero能够识别中国知网。如下图所示，其他操作类似。

c. 豆瓣

d. Wikipedia

维基百科大家用的非常多，Zotero也能够识别维基百科的搜索条目，如下图所示。

除了上面提及一些，Zotero还能识别更多其他数据库和网站，如常用的Web of Science，Youtube等等，这里就不再一一举例，大家可以自己试试。

Zotero下载99%文献

下面具体介绍如何将Sci-Hub作为PDF解析器！

设置Sci-Hub作为PDF解析器

PDF resolvers的设置在Zotero的Config Editor中。

我们打开Zotero的首选项，进入Advanced-->Config Editor。

搜索extensions.zotero.findPDFs.resolvers，如下。

双击extensions.zotero.findPDFs.resolvers，默认情况下是只有一对[]。

删除[]，并将以下代码粘贴进去。

{
    "name":"Sci-Hub",
    "method":"GET",
    "url":"https://sci-hub.ren/{doi}",
    "mode":"html",
    "selector":"#pdf",
    "attribute":"src",
    "automatic":true
}

然后点击OK。

到此就成功将Sci-Hub配置为PDF解析器了，也就是说替代了默认的Unpaywall。

现在，无需重启Zotero，即可调用Sci-Hub免费下载文献了。

这里顺便提三点：

在"url":"https://sci-hub.ren/{doi}"中，目前可用的域名有.tw、.ren、.si、.shop，大家可以挑选其中一个，哪个用起来体验更好就用哪个。（当然，由于Sci-Hub经常更换域名，保不准改天哪个域名就挂了，或者有新的域名出来，因此此处的代码未来也会根据需要进行更新）
从"url":"https://sci-hub.ren/{doi}"还能看到一点。由于Sci-Hub是通过doi下载文献的，因此该PDF解析器也需要doi。也就说你的文献必须要有doi，如果doi是空缺的，便无法通过PDF解析器免费下载文献。幸运的是，对于缺失doi的文献，我们可以通过插件zotero-shortdoi插件一键抓取doi。
"automatic":true，如果设置为true，Zotero会自动下载保存到Zotero中的文献的PDF。比如你用Zotero Connector保存了一些文献到Zotero，它便会自动帮你从Sci-Hub下载文献，并附在相应文献条目下。如果你不需要自动下载，可以设置为"automatic":false。

使用方法前面介绍过，主要有两种：

第一种：Zotero Connector

通过Zotero Connector保存的文献，会自动下载PDF，无需任何操作。（看不到进度条，下载速度取决于网速）

第二种：Find Available PDF

选中单篇或者多篇文献，手动点击右键菜单中的Find Available PDF，会弹出单独的窗口显示下载进度。同样，下载速度取决于网络速度。

关于下载速度取决于网络速度有下面两点需要注意；

如果你未开启任何网络加速器（比如梯z），即正常使用网络，可以认为Find Available PDF的进度接近你手动从Sci-Hub下载文献的速度。大家应该都体验过，不开启加速器的情况下，Sci-Hub的访问速度还是比较慢的，甚至有时候PDF加载不出来。
假如你开启了加速器，推荐使用全局代理模式，而不是PAC模式，因为两种情况下Find Available PDF的进度差异比较大（当然如果你不介意下载速度，使用PAC模式也是可以的）。不过提醒一下，下载完文献，记得切回到PAC模式，因为全局模式下Zotero无法同步文献到坚果云。
可以看到，搭配Sci-Hub后，Zotero变得更加完美了！这就是开源软件的魅力，它能带来无限的想象空间。